Но поскольку иудаизм учит, что праведники всех народов «имеют долю в мире грядущем», он не желает доказывать ошибочность какой-либо религии. Он лишь надеется, что каждый еврей, и каждый христианин будут следовать высшим идеалам своей собственной веры.
Однако Мендельсон был глубоко потрясен тем, что даже от еврея, достигшего такого успеха, какого достиг он, могут потребовать публичной защиты своей религии; к тому же этого потребовал христианин, которого он считал своим другом. Этот вызов стал поворотным пунктом в жизни Мендедьсона. Он начал перевод Торы на немецкий язык, стал помогать евреям в изучении немецкого языка, чтобы им было легче встретить вызов со стороны нееврейского мира.
Мендельсон содействовал также открытию Еврейской свободной школы — первой школы, где еврейские дети изучали литературу и на иврите, и на немецком языке.